2024-06-19 19:25:19 发布
网友
我想找到相当于2个不同核苷酸的IUPAC。你知道吗
例:我有A和C,我要M。 或者:我有R和T,我想要D
有没有一种方法可以在Biopython中做到这一点?(听起来很简单,但我只找到了使用对齐的方法,这在我的情况下并不合适。)
谢谢!你知道吗
我想你在Bio.Data.IUPACData里找字典,比如:
Bio.Data.IUPACData
>>> from Bio.Data import IUPACData >>> d = {v:k for k,v in IUPACData.ambiguous_dna_values.items()} >>> d['AC'] 'M'
注意,这里反转字典映射意味着我们丢失了一个键,因为'X'和'N'都映射到'GATC'。你知道吗
'X'
'N'
'GATC'
我想你在
Bio.Data.IUPACData
里找字典,比如:注意,这里反转字典映射意味着我们丢失了一个键,因为
'X'
和'N'
都映射到'GATC'
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