将DICOM转换为TIFF

Question

我是Python新手，所以请原谅我的无知，如果我没有所有的信息正确。我试着用光栅扫描一个目录，把里面所有的DICOM文件转换成TIFF文件。我已经得到了搜索功能，但我有一个困难的时间保存图像为tiff。我正在使用pydicom库读入DICOM并操作头信息。另外，我尝试过使用pydicom中的save_as函数来保存到TIFF，但是我更愿意使用PIL中的save函数来正确设置TIFF的压缩。我想问题是我不能/不明白如何从DICOM中提取实际的图像数据并将其放入新的图像。任何我们将非常感谢您的帮助。。。干杯

Python 2.7 第1.1.7条 Pydicom 0.9.6版

Answer 1

前些时候在网上找到了同一个问题的答案，虽然我不记得这个网站，但当我将它应用到我的代码中时，也在这里为其他人共享：

 import pylab
 import dicom
 ImageFile=dicom.read_file(<SourceFilePath>) #Path to "*.dcm" file
 pylab.imshow(ImageFile.pixel_array,cmap=pylab.cm.bone) #to view image

或者，如果要保存图像，请使用： pylab.imsave('<DestinationFilePath>',ImageFile.pixel_array,cmap=pylab.cm.bone)

默认情况下，imsave将以.png格式保存图像。如果受支持，可以在imsave()中指定所需的格式。在

希望有用。在

Answer 2

如果您知道如何使用PIL将图像数据另存为.tiff，this example应该可以帮助您将图像数据从pydicom传递到{}（还有更多的here in the comments）。在