一个Python包来获取任何pdb的ramachandranplot。
ramachandranplot的Python项目详细描述
拉玛钱德兰图
Python3 Ramachandran地块的实施
包与Python2.7兼容,但建议使用Python3
为了便于安装,请使用pip:
pip install ramachandranplot
用法:
^{pr2}$输出示例:
依赖项:
运行ramachandarnplot需要matplotlib,numpy和biopython
要在标准Linux系统上安装它们:
pip install python3-matplotlib
pip install python3-biopython
pip install python3-numpy
有关标准PSI和PHI首选项,请参见:
Lovell等人。通过Calpha几何结构验证:φ、psi和Cbeta偏差。2003年;DOI:10.1002/prot.10286
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