微单体型序列数据模拟分析软件包

microhapulator的Python项目详细描述


MicroHapulator build statusTest coveragePlatform supportinstall with biocondaBSD licensed

微触觉器

Daniel Standage,2018-2019年
https://github.com/bioforensics/microhapulator

microhaptitor是一个用于分析和解释微单体型序列数据的软件包,用于法医学分析。 它为基因分型以及简单和复杂样本的确定性和概率解释提供了工具。 它还提供了构建模拟基因型和模拟单个和多个贡献者样本的MPS序列的工具。 微触觉器依赖于来自MicroHapDB的微hap标记定义和群体等位基因频率,以及InSilicoSeq包含的MPS误差模型。在

安装

建议使用bioconda安装。在

conda install -c bioconda microhapulator

NOTE: If you'd prefer to install with pip, see .travis.yml and setup.py for hints.

交互式演示

点击下面的徽章启动一个快速互动演示微触觉器。在

Binder

使用

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贡献

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