提供一个python api来操作mip
pymip的Python项目详细描述
#派米普[！[Pypi版本][Fury图片]][Fury网址][！[生成状态][Travis图像][Travis URL] 提供一个python api来操作[mip][mip]分析管道：设置、启动、监视和分析输出。
###特征
- 待办事项
归档分析 案件破案或者立案后，必须对分析结果进行总结，并将分析结果存档Pymip将通过捆绑输出中最重要的资产并删除其余资产来处理此任务
保存的资产：
- CRAM文件作为原始（对齐）读取的源
- BCF文件作为所有（未注释的）变体的源
- 质量控制指标作为质量指标的来源
pymip不会接触“exomes/genomes”下的任何文件，仅“analysis”。实际上，这些文件将被收集在“exomes/genomes”名称“archive”下的文件夹中。该脚本还将更新QC示例信息文件中的AnalysisRunStatus，以存档
##安装以进行开发
`bash $ pip install --editable . `
##贡献 任何人都可以帮助使这个项目更好-阅读[贡献]（contribution.md）开始！
##许可证 麻省理工学院。有关详细信息，请参阅[许可证]（许可证）文件。
[愤怒的url]：http://badge.fury.io/py/pymip [愤怒的图像]：https://badge.fury.io/py/pymip.png
[travis url]：https://travis-ci.org/Clinical-Genomics/pymip [特拉维斯图像]：https://img.shields.io/travis/Clinical-Genomics/pymip.svg?style=flat
[mip]：http://mip-api.readthedocs.org/en/latest/
欢迎加入QQ群-->： 979659372
