橙色生物信息学附加组件橙色数据挖掘软件包。
Orange3-Bioinformatics的Python项目详细描述
Orange3生物信息学
橙色生物信息学扩展了数据挖掘软件orange 包，具有生物信息学的通用功能。提供的 功能可以作为python库或通过可视化 编程接口（橙色画布）。后者也适用于 非程序员。
在橙色画布中，分析员连接基本的计算单元，称为 小部件，进入数据流分析模式。两个单元的小部件可以是 如果共享数据类型，则连接。与其他流行的工具如 小酒馆，橙色的小部件是高级的，集成的潜在复杂性 任务，但足够具体，可以独立使用。甚至精心制作 分析很少包含超过10个小部件；而 聚类和富集分析最多可以用5个 小部件。在构建模式时，每个小部件都是独立控制的 有了设置，这些设置在概念上不会给分析员带来负担。
橙色生物信息学提供了对公共可用数据的访问，如地理数据集、go和kegg。 所有功能都可以与强大的可视化、网络探索和 橙色数据挖掘框架中的数据挖掘技术。
安装
要使用pip安装附加组件，请使用
pip install Orange3-bioinformatics
用橙色注册此加载项，但将代码保存在开发目录中（不要将其复制到 python的site packages目录），运行
pip install -e .
文档/小部件帮助可以通过运行生成
make html htmlhelp
从文档目录。
用法
安装之后，这个附加组件中的小部件将注册为橙色。要从终端运行橙色，请使用
python3 -m Orange.canvas
或
orange-canvas
新的小部件在生物信息学部分的工具箱栏中。
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