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关于生物相关联的Python项目和问题：

Python进程路径-从学徒到大师

我学习、工作和玩Python已经一年半了。作为一名生物学家慢慢转向生物信息学，这种语言一直是我在实验室所做的所有主要贡献的核心，我或多或少地爱上了Python允许我表达漂亮解决方案的方式，也爱上了这 ...

2024-05-04 已阅读: n次

TypeError:“tuple”对象不能解释为整数

我试着做一个超级基本的进化模拟器，生成十个随机的“生物”，每个都是一个数字值，然后给它们一个随机的“变异”，但它不断地向我抛出这个错误：“对于我在范围内（生物）： TypeError:“tuple”对 ...

2024-05-04 已阅读: n次

python中的图像处理：输入带有许多精子/卵子细胞的照片，需要找到这些细胞的面积

我正在与一个生物实验室合作进行一个项目，该实验室有数千张从显微镜上拍摄的细胞（精子和卵子）图像。我的工作是自动计算每个图像中的细胞数并记录它们的面积。我对sobel/canny边缘检测做了一些研究，但 ...

2024-05-04 已阅读: n次

带有mechanicalsoup的表单请求未显示预期结果

我是一个网络抓取和网络事物的新手（但基本上习惯于Python），我想了解如何将网站搜索整合到生物信息学研究工具中。在目标：检索http://www.lovd.nl/3.0/search上表单的输出 ...

2024-05-04 已阅读: n次

如何在函数中修改全局变量？

我一直在努力整理我的神经网络进化模拟器的代码，因为它已经长到了1000多行，而且很难阅读。这个过程的一部分涉及将代码块从主循环移动到它们自己的函数（事件处理、绘图到屏幕等）或它们自己的模块中。然而，我 ...

2024-05-04 已阅读: n次

方差分析

我希望我能说得尽可能清楚。我有一个包含400个研究对象的excel文件，每一个都有他们的年龄、性别和40多列生物变量。 Es:CODE0001；（年龄）20岁；M\F；生物价值1；生物价值2。。。。 ...

2024-05-04 已阅读: n次

Python寻找最长的ORF

有人能给我一个简单的方法来计算最长的开放阅读框（ORF）>；DNA序列的长度是30个碱基？ATG是起始密码子（即ORF的开始），TAG、TGA和TAA是终止密码子（即ORF的结束）。没有使用生物 ...

2024-05-04 已阅读: n次

如何在Python中访问OpenCV houghcirles结果？

我正在为虹膜相关生物识别技术开发一种概念验证算法。我想能够在一系列的图像上测试它，但是为了做到这一点，我需要知道虹膜的边界。根据所使用的技术，我对图像进行了过滤和智能阈值处理（Otsu的方法），只留下 ...

2024-05-04 已阅读: n次

在imag中为不同的生物细胞分配不同的颜色

我需要给图像中不同的生物细胞分配不同的颜色。你知道吗更具体地说，图像只是黑白的（所以只有0和255的矩阵）。单元格的内容（不包括边界）用白色表示，而单元格边界用黑色表示。每个单元格都由一些单元格边界 ...

2024-05-04 已阅读: n次

读取文件并查看lst中的数字是否为数字

问我的问题：在《神话中的所有生物》一书中，侏儒是善良的，有胡须的生物，而地精则倾向于专横和头脑简单。地精喜欢骚扰侏儒，让他们按胡子的长度排列成三人一组。由于侏儒的身高不同，他们会改变自己的布局来迷惑 ...

2024-05-04 已阅读: n次

在Python中展平范围对（heapy/bisect？）

在生物信息学中，我们进行了大量的以下转换： >>> data = { (90,100):1, (91,101):1, (92,102):2, (93, ...

2024-05-04 已阅读: n次

从文本文件复制行删除格式Python

我试图从一个文件中读取文本，然后从用户的输入中打印出相应的莎士比亚十四行诗。[如果用户输入1，则打印十四行诗1，等等]。在我有下面的代码函数，但是，我希望答案没有所有的格式 'def serve_p ...

2024-05-04 已阅读: n次

LogGabor

[！[活页夹]（https://mybinder.org/badge.svg)](https://mybinder.org/v2/gh/bicv/LogGabor/master） [！[PYPI版本] ...

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cornstover

内容 What is cornstover? Installation Getting started Bug reports License information About the au ...

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django-biometrics

将生物识别标记与用户关联此包Python名称：django-biometrics 目前版本： django-biometrics 1.0 ...

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bmicp

#bm_icp（气孔生物模块迭代表征） ##安装 pip安装bmicp ##使用待办事项 ##示例待办事项 ...

2024-05-04 已阅读: n次

onedep-biocuration-api

见：http://wwpdb.org/ ...

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bio-pype

构建、组织和标准化的简单而纤细的python框架生物信息学分析。 The system is built around the python argparse module, to provide ...

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biopy-isatab

用于isatab的python解析器，一种用于实验元数据的生物文件格式此包Python名称：biopy-isatab 目前版本： biopy-is ...

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bioconvert

bioconvert是一个协作项目，旨在促进生命科学数据从一种格式相互转换。 contributions:Want to add a convertor ? Please jo ...

2024-05-04 已阅读: n次

mindstrong

该软件包使用监督的核主成分分析和交叉验证，将数字生物标志物数据拟合到目标测量。该软件由mindstrong健康数据科学团队的成员编写： Paul Dagum, MD, PhD Greg Rysli ...

2024-05-04 已阅读: n次

seq-tools

#py seq tools用于处理生物序列、对齐和格式的免费python库。这些库是au公共脚本的一部分，我还没有很好地记录它们。这里的目标是将它们放入一个包中，并使它们得到更好的文档记录。从长远来看 ...

2024-05-04 已阅读: n次

dataframer

数据框尝试将任何文件加载到pandas数据帧中，以最少的配置，关注生物信息学示例通常，您将从磁盘读取文件（open('my-file.txt', 'rb')）。但是字节流在这里更简单。 ...

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biostructmap

生物结构图 biostructmap是一个python工具，用于映射与序列对齐的数据（例如多态性的位置）在蛋白质结构上。此外，BioStructMap允许残余物的 ...

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biotools

伴奏巴特，丽贝卡，等。木薯白叶枯病菌株的高通量基因组测序确定了持久抗性的保守效应器。pnas加。目前依赖于clustalw和BLAST。您可以从github或通过git获取最新的代码 git克隆 ...

2024-05-04 已阅读: n次

kappagate

kappagate是一个python库，建立在kappy之上，以python的方式使用kappa语言（用于模拟生物复合过程），使用python对象定义代理和规则，并使用一些方法用于绘制复合物和时间序 ...

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django-triodia

triodia是一个django应用程序，用于解析分类名称并将其与公共生物多样性数据服务的数据库进行核对。Triodia目前主要的API调用依赖于全球生物多样性确认工具（GBIF），可以认为是该API ...

2024-05-04 已阅读: n次

bioFuzz

#生物模糊 ##概述生物信息学发展的模糊测试。一个想法，我一直试图激励自己做了一段时间了。与其说是一个实际的项目，不如说是一个现阶段的沉思。 ##安装应该简单到 pip install bio ...

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cobratools

眼镜蛇工具眼镜蛇实验室用于生物信息学的各种工具。开始这些说明将为您在本地计算机上启动和运行项目的副本，以便进行开发和测试。先决条件需要Python3.6或更高版本。所有其他要求都包含在req ...

2024-05-04 已阅读: n次

fluxpyt

流动性这个软件包是用来进行固定的13C代谢通量分析的估计细胞内流量分布的计算。 fluxpyt是用python3写的。水蟒包裹清单见 requirements.txt文件。该软件包是作为Des ...

2024-05-04 已阅读: n次

Biofuel-MyProject

自述v3.0/14 2018年3月标志：！[alt]（myproject/2.png“团队徽标”） ###qspr建模：机器学习算法在生物燃料化合物族分类、闪点和十六烷值预测中的应用 ###简介这 ...

2024-05-04 已阅读: n次

ghini.desktop

travis pypi coveralls Spanish Portuguese French Ukrainian Hungarian Ital ...

2024-05-04 已阅读: n次

Python 生物

关于生物 相关联的Python项目和问题：

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