橙色生物信息学附加组件橙色数据挖掘软件包。
Orange-Bioinformatics的Python项目详细描述
橙色生物信息学扩展了数据挖掘软件Orange 包,具有生物信息学的通用功能。提供的 功能可以作为python库或通过可视化 编程接口(橙色画布)。后者也适用于 非程序员。
在橙色画布中,分析员连接基本的计算单元,称为 小部件,进入数据流分析模式。两个单元的小部件可以是 如果共享数据类型,则连接。与其他流行的工具如 小酒馆,橙色的小部件是高级的,集成的潜在复杂性 任务,但足够具体,可以独立使用。甚至精心制作 分析很少包含超过10个小部件;而 聚类和富集分析最多可以用5个 小部件。在构建模式时,每个小部件都是独立控制的 有了设置,这些设置在概念上不会给分析员带来负担。
橙色生物信息学提供了对公开数据的访问, 像地理数据集、Biomart、Go、Kegg、Atlas、Arrayexpress和Pipax 数据库至于分析,有基因选择,质量控制, 多因素实验之间的评分距离。所有特征 可以与强大的可视化、网络探索和 橙色数据挖掘框架中的数据挖掘技术。
文档:http://orange-bioinformatics.readthedocs.org/