亚基因组框架
mgkit的Python项目详细描述
这个库[1]的目的是提供一系列有用的模块和包,以便更容易地为元基因组学或任何类型的生物信息学分析构建自定义管道。它集成了生物信息学中其他著名的python库,如HTSeq、pysam、numpy和scipy。
在Documentation中提供了一个教程管道。文档中使用的数据和脚本可在[2]获得。
讨论邮件列表可在mgkit-users找到。
引用
鲁比诺,F.和克里维,C.J.,2014年。MGKIT:微生物群落研究的亚基因组框架。。网址:figshare[doi:10.6084/m9.figshare.1269288]。`
还可以使用mgkit.cite()函数或对包含的所有脚本使用–cite选项来引用。这将输出以下内容