读取荧光相关光谱（fcs）数据文件
fcsfiles的Python项目详细描述
fcsfiles是一个python库，用于读取carl zeiss（r）confocor（r）raw和ascii 测量数据文件。
| Author: | Christoph Gohlke |
|---|---|
| Organization: | Laboratory for Fluorescence Dynamics. University of California, Irvine |
| Version: | 2019.1.1 |
修订版
- 2019.1.1
- 更新版权年。
注释
“卡尔蔡司”和“Confocor”是卡尔蔡司公司的注册商标。
本实施方式的使用可能受到专利或许可的限制 限制。
api还不稳定，预计会在不同的版本之间发生变化。
不推荐使用Python2.7和3.4。
此模块不读取流式细胞术标准fcs文件。
示例
从confocor3 ascii文件中读取countratearray作为numpy数组：
>>> fcs = ConfoCor3Fcs('ConfoCor3.fcs')
>>> fcs['FcsData']['FcsEntry'][0]['FcsDataSet']['CountRateArray'].shape
(60000, 2)
从confocor3原始文件中读取数据和元数据：
>>> fcs = ConfoCor3Raw('ConfoCor3.raw')
>>> fcs.filename()
'f5ee4f36488fca2f89cb6b8626111006_R1_P1_K1_Ch1.raw'
>>> fcs.frequency
20000000
>>> times = fcs.asarray()
>>> times[10858]
1199925494
>>> times, bincounts = fcs.asarray(bins=1000)
>>> times.shape
(1000,)
>>> bincounts[618]
23
>>> fcs.close()
从confocor2原始文件中读取数据和元数据：
>>> fcs = ConfoCor2Raw('ConfoCor2.raw')
>>> fcs.frequency
20000000
>>> ch0, ch1 = fcs.asarray()
>>> ch1[4812432]
999999833
>>> times, ch0, ch1 = fcs.asarray(bins=1000)
>>> times.shape
(1000,)
>>> ch1[428]
10095
>>> fcs.close()
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