easyqp:OpenSWATH的简单库生成
easypqp的Python项目详细描述
easyqp:OpenSWATH的简单库生成
easyqp是一个Python包，它为OpenSWATH提供简化和快速的肽查询参数生成。它可以处理来自MSFragger或其他数据库搜索引擎的pepXML格式的输入。统计验证可以使用PyProphet或PeptideProphet/iProphet进行。使用内部或外部标准校准保留时间。除了累积库之外，还为OpenSWATH中的非线性RT校准生成特定于运行的库。在
安装
我们强烈建议在Python virtualenv中安装easyqp。easyqp与python3兼容。在
从GitHub安装easypqp的开发版本：
$ pip install git+https://github.com/grosenberger/easypqp.git@master
运行EasyQP
EasyPQP不仅是一个Python包，还是一个命令行工具：
^{pr2}$或者：
$ easypqp convert --help
$ easypqp library --help
码头工人
EasyQP也可从Docker（自动构建）获得：
从DockerHub（与GitHub同步）中提取easypqp的开发版本：
$ docker pull grosenberger/easypqp:latest
- 项目
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欢迎加入QQ群-->： 979659372
