内部生物信息学python包之间共享的公共代码
bbcu.bioutils的Python项目详细描述
下降
内部生物信息学python包之间共享的通用代码，例如：
- 分析fastqc输出
- 操作fasta序列
- 建立和使用将genebank id（gi）转换为学名的数据库
python版本
此项目当前正在使用Python2.7
安装
建议使用virtualenv创建干净的python环境。
要安装bioustils，请使用pip：
pip install bbcu.bioutils
测试
要运行单元测试，请使用：
nosetests
或：
tox
此套件包括单元测试和更耗时的集成测试
执行
此项目附带的主脚本是gi2name.py，请通过运行查看其选项：
数据库由脚本生成：build taxonomy db.py
欢迎加入QQ群-->： 979659372
