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Python alignments
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最新问答
我在下面编写了一个函数,它调用一个函数(调用外部程序)。我已经将它写为仅限于提供的#个核心,它等待当前所有任务完成,然后再分配更多的任务。你知道吗
我确信有一个更好的方法-我怎样才能观察完成的过程,然 ...
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我有这样的剧本
for b in range(len(xy_alignments.keys())):
print str(b) + " : " + str(len(xy ...
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我在曲面上有一些点(我没有数学公式)。你知道吗
我有一个算法,可以给我曲面的法向量(实际上,它和给我点的是同一个),但是,不幸的是,法向量没有“对齐”。你知道吗
我的意思是,返回法向量n的算法任意返回 ...
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看起来很奇怪。一个名为类的变量被打印出来,但在尝试执行filter(...)构造时未定义。在
这里有一个代码:
def start(self, tag, attrib):
classes = ...
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我正在尝试将一系列的基因组坐标合并成连续的范围,还有一个额外的选择,可以跨间隙合并。在
例如,如果我有基因组范围[[0, 1000], [5, 1100]],我希望结果是[0, 1100]。如果{cd ...
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我尝试在biopython的循环中对大约10000对字符串运行成对全局对齐方法。每个字符串平均长度为20个字符。对一对序列运行该方法效果良好。但是在一个循环中运行这个,对于低至4对,会导致分段错误。如 ...
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我正在寻找一些关于以下搜索脚本我有一些建议。任何帮助都会很好。你知道吗
下一行是我的输入(查询)文件(“out.list.txt文件“”)
IVVTGPHKFNRCPLKKLAQSFTMPTSTFVD ...
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所以我一直在试着和Biopython合作,我还是个新手。我的代码:
fasta_string = open("C:\\Users\\saeed\\Desktop\\dna2.fasta").read( ...
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output is like
我使用可美化的python以表格形式显示了来自数据库的结果。但结果是无组织的。你知道吗
try:
connection = mysql.connector.con ...
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我正在尝试编写一个Python3脚本,它执行两个序列的全局对齐,长度分别为10 kb和11 kb。两者非常相似。(我正试图找到它们不匹配的几个点,我知道其中一个点接近查询序列的末尾,这就是为什么局部对 ...
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我想添加一个包含两列的数据框:read\u id和score
我正在使用以下代码:
reads_array = []
for x in Bio.SeqIO.parse("inp.fas ...
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我有两个numpy矩阵:
matrix_a = np.random.random((2, 3))
matrix_b = np.random.random((2, 3, 5))
使用以下函数,我为ma ...
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最新项目
这个python包提供了一个快速的计算实现
optimal pairwise alignments of molecular sequences
ML distance estimates of ...
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用于合并路线的包
此包Python名称:pyali
目前版本: pyali 0.1.1
最后维护时间:Nov 15, 2017
...
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