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关于bel 相关联的Python项目和问题：

Python：将选择查询列表转换为di

正在尝试转换以dict此SELECT查询，因为我有重复的名称。在 def getcity(): conn = databaseConnection() cur = conn.cursor() c ...

2024-06-18 已阅读: n次

从DataFram中按计数删除行

使用以下数据帧。。。你知道吗 line_date line_track line_race c1pos horse_name ...

2024-06-18 已阅读: n次

基于重复的第一个元素从列表列表中删除重复项

数据如下 data = [["'id'", "'state'", "'country'\n"], ['44', "'WD'", "'India'\n"], ['5 ...

2024-06-18 已阅读: n次

将电话号码和字符串解析为datafram中的新列

我在一列中有一个地址列表address，如何将电话号码和餐厅类别解析为新的列？我的数据框是这样的 address 0 Arnie Morton's of Chicago 435 S. La Cie ...

2024-06-18 已阅读: n次

python3中排序字符串的所有不等子集

我想找出一个排序字符串的所有子集，不考虑顺序和相邻的字符。我认为最好的解释方法是举个例子。结果也应该从最长到最短。你知道吗这些是bell的结果。你知道吗 bell bel bll ell be bl ...

2024-06-18 已阅读: n次

估计海森矩阵和以下错误：数值错误：使用序列设置数组元素

我想估计对数似然函数的海森函数。我估计了arima模型和garch模型的参数。我用hessian函数来求hessian函数。但是现在我得到了一个错误：ValueError：用序列设置数组元素。eps出 ...

2024-06-18 已阅读: n次

如何在Pandas系列中的两个元素之间切片

我有一个系列，包含一列名称和他们的国籍在括号里。我希望此列只包含个人国籍，不包含括号，索引相同。你知道吗 0 LOMBARDI Domingo (URU) 1 ...

2024-06-18 已阅读: n次

Python猎鹰API - 内部/外部 Python包使用最佳实践？

我有一个名为'bel'的外部独立python包，它有自己的CLI脚本，使用基于Falcon的restapi来验证术语库中的术语。我还在restapi中使用这个包来支持restapi的大部分功能。你知道 ...

2024-06-18 已阅读: n次

使用特定条件将嵌套JSON转换为数据帧

在下面考虑JSON（Orjiar JSON的一个片段） { "Data": { "abc": [ { "Month": ...

2024-06-18 已阅读: n次

如何将字符串解析为datafram

为了演示，我正在尝试构建一个自包含的Jupyter笔记本，它将一个长地址字符串解析成pandas数据帧。目前，我必须突出显示整个字符串并使用pd.read_clipboard： data = pd.r ...

2024-06-18 已阅读: n次

如何将第二行解析为第二列

我试图把一个文本文件分为两列。文件遵循两个地址的结构，第一个地址需要进入第一列，第二个地址需要进入第二列。然后需要在注释行（########################）之后的每两个地址重复一次 ...

2024-06-18 已阅读: n次

如何在dataframe中用多个列值替换一个列值

输入数据帧 Date Geo Shipment 2020-01-01 USA 1000 2020-01-01 BRA ...

2024-06-18 已阅读: n次

pathme

pathme是一个python包，旨在将kegg[2][3][4]、reactome[5][6]、wikipathways[7][8][9]转换为生物表达语言。它是Compath Web应用程序的 ...

2024-06-18 已阅读: n次

bio2bel-go

将基因本体（go）转换为bel 安装 bio2bel_go可以通过PyPI轻松安装您最喜爱的终端中的以下代码： $ python3 -m pip install bio2bel_go 或者来自G ...

2024-06-18 已阅读: n次

bel-resources

bel资源文件的实用程序。安装从PyPI安装，使用： $ pip install bel-resources 或者使用以下命令从GitHub获取最新代码： $ git clone https: ...

2024-06-18 已阅读: n次

bio2bel-wikipathways

这个包通过包装restful api，允许用wikipathways信息丰富bel网络。此外，它还集成在ComPath environmentfor pathway数据库中比较。安装 bio2 ...

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bio2bel-mirtarbase

将文本挖掘的mirna目标交互序列化为bel 安装 bio2bel_mirtarbase可以通过PyPI轻松安装在您喜爱的终端中执行以下代码： $ python3 -m pip install b ...

2024-06-18 已阅读: n次

bio2bel-interpro

将interpro蛋白家族、结构域和其他类转换为bel中的本体关系。安装 bio2bel_interpro可以通过PyPI轻松安装在您喜爱的终端中执行以下代码： $ python3 -m pip ...

2024-06-18 已阅读: n次

bel-enrichment

用于生成固化片以合理地丰富bel图的包。如果你觉得bel_enrichment对你的工作有用，请考虑引用[1]： [1]Hoyt, C. T., et al (2019). Re-curati ...

2024-06-18 已阅读: n次

bio2bel-famplex

Famplex的蛋白质复合物和家族结构。安装 bio2bel_famplex可以从 PyPI 在您喜爱的终端中使用以下代码： $ python3 -m pip install bio2bel_fa ...

2024-06-18 已阅读: n次

bio2bel-drugbank

将DrugBank 5.0转换为BEL。安装 bio2bel_drugbank可以通过PyPI轻松安装您最喜爱的终端中的以下代码： $ python3 -m pip install bio2be ...

2024-06-18 已阅读: n次

pathme-viewer

此Web应用程序旨在方便查询、浏览和导航在生物学中形式化的路径知识表达语言（BEL）。当它与PathMe平行建造时，有助于探索由这个包协调的数据库，pathme查看器支持可视化 BEL文件的。 B ...

2024-06-18 已阅读: n次

bio2bel-hmdd

将人类microrna疾病数据库转换为bel 引文李勇，邱丙，屠杰，等。hmdd v2.0：实验支持的人类microrna和疾病关联数据库。核酸研究2014；42（数据库问题）：D1070-D10 ...

2024-06-18 已阅读: n次

bio2bel-hgnc

此软件包将创建： hgnc bel命名空间 hgnc基因家族bel名称空间， hgnc基因家族成员bel脚本正畸bel脚本安装 bio2bel_hgnc可以通过PyPI轻松安装在您喜爱的终 ...

2024-06-18 已阅读: n次

pybel-ols

pybel[1]扩展，用于使用ebi[2]本体构建bel资源查找服务。安装获取最新使用以下命令从GitHub下载最新代码： $ pip install git+https://github ...

2024-06-18 已阅读: n次

pybel-cx

用于与cx相互转换的pybel扩展。安装 pybel cx可以从PyPI轻松安装，代码如下您最喜欢的终端： $ python3 -m pip install pybel-cx 或者来自GitH ...

2024-06-18 已阅读: n次

bennellickeng.kitdrivers

Bennellick工程有限公司工具包驱动程序这个python包由bel用来控制测试设备的各种驱动程序类组成。用于开发的机器范围安装 #!bash pip install -U --user -e ...

2024-06-18 已阅读: n次

bel-repositor

用于使用pybel[1]从bel文档存储库加载数据的实用程序。安装 bel_repository可以使用以下命令从pypi安装： $ pip install bel_repository 最新版 ...

2024-06-18 已阅读: n次

bio2bel-hsdn

将Zhou和Himmelstein生成的人类症状疾病网络转换为BEL 非常感谢daniel himmelstein在他的存储库中对这些数据进行预处理：https://github.com/dhimme ...

2024-06-18 已阅读: n次

bio2bel-adeptus

将adeptus疾病差异基因表达特征转换为bel。非常感谢Daniel Himmelstein对其存储库中的数据进行了预处理，地址为： https://github.com/dhimmel/adep ...

2024-06-18 已阅读: n次

bio2bel-mesh

将网格层次结构转换为bel 安装 bio2bel_mesh可以通过PyPI轻松安装在您喜爱的终端中执行以下代码： $ python3 -m pip install bio2bel_mesh 或者 ...

2024-06-18 已阅读: n次

bio2bel-uniprot

将UniProt转换为BEL 安装 bio2bel_uniprot可以通过PyPI轻松安装您最喜欢的终端中的以下代码： $ python3 -m pip install bio2bel_unipr ...

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