将mirtarbase转换为bel的包
bio2bel-mirtarbase的Python项目详细描述
将文本挖掘的mirna目标交互序列化为bel
安装
bio2bel_mirtarbase可以通过PyPI轻松安装 在您喜爱的终端中执行以下代码：
$ python3 -m pip install bio2bel_mirtarbase
或者来自GitHub上的最新代码，使用：
$ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/mirtarbase.git@master
设置
mirtarbase可以从python repl或自动安装的命令行下载和填充 公用事业。
Python复制
>>>importbio2bel_mirtarbase>>>mirtarbase_manager=bio2bel_mirtarbase.Manager()>>>mirtarbase_manager.populate()
命令行实用程序
bio2bel_mirtarbase populate
引文
- Chih Hung Chou等人；Mirtarbase 2016：实验验证的mirna靶相互作用数据库的更新。 核酸研究2016；44（D1）：D239-D247。doi:10.1093/nar/gkv1258
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