将周和希梅尔斯坦产生的人类症状疾病网络转换为bel
bio2bel-hsdn的Python项目详细描述
将Zhou和Himmelstein生成的人类症状疾病网络转换为BEL
非常感谢daniel himmelstein在他的存储库中对这些数据进行预处理:https://github.com/dhimmel/hsdn
安装
bio2bel_hsdn可以从 PyPI 在您喜爱的终端中使用以下代码:
$ python3 -m pip install bio2bel_hsdn
或者来自GitHub上的最新代码,使用:
$ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/hsdn.git
设置
此存储库当前不缓存数据,但仅包装转换为BEL。
Python复制
>>>importbio2bel_hsdn>>>hsdn_manager=bio2bel_hsdn.Manager()>>>graph=hsdn_manager.to_bel()