方便地处理带注释的整张幻灯片图像
WSI-handling的Python项目详细描述
WSI\U处理
数字病理金字塔全幻灯片图像（WSIs）处理代码。目前可以使用Aperio ImageScope中的注释XML或来自QuPath的注释json以及Openslide支持的图像格式。在
支持以所需的每像素微米（mpp）从WSI获取平铺，获取整个WSI或带注释的区域，为平铺或WSI生成遮罩图像，并显示平铺在WSI上的位置。在
批注格式
示例注释在./Example_annotations中提供
XML批注必须遵循AperioImagescope格式：
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><Annotations><AnnotationLineColor="65280"><Regions><Region><Vertices><VertexX="56657.4765625"Y="78147.3984375"/><VertexX="56657.4765625"Y="78147.3984375"/><VertexX="56664.46875"Y="78147.3984375"/></Region></Regions></Annotation></Annotations>
包含更多<；Annotation>；或<；Region>；块以用于其他注释。在
json注释必须遵循qpath的json导出格式，即GeoJSON：
^{pr2}$安装
pip安装WSI\U处理
使用
见https://github.com/pjl54/WSI_handling/blob/master/wsi_demo.ipynb
- 项目
标签：
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