基于变启发式的bionetgen和sbml模型并行拟合的应用
pybnf的Python项目详细描述
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pybionetfit（pybnf）是一个通用程序，用于参数化使用bionetgen指定的生物模型 基于规则的建模语言（bngl）或系统生物学标记语言（sbml）。pybionetfit提供了一套 并行元启发式算法（差分进化、粒子群优化、分散搜索） 参数优化。除了模型参数化，pybnf还支持通过 bootstrapping或bayesian方法，以及模型检查。pybnf包含生物属性规范语言 （bpsl）用于定义用于参数化或检查的定性数据。它在大多数linux和macos上运行 工作站以及计算集群。
有关文档，请参阅[documentation_pybionetfit.pdf]（documentation_pybionetfit.pdf）或<；https://pybnf.readthedocs.io/en/latest/>；上的联机文档。
pybionetfit是根据bsd-3许可证发布的。有关更多信息，请参见 [许可证]（许可证）。LANL代码名称：C18062
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