ppanini:通过自动化数据网络集成对新的和重要的基因的功能注释进行优先排序和预测。
ppanini的Python项目详细描述
ppanini(通过自动化数据网络集成对新的和重要的基因的功能注释进行优先排序和预测)提供了一个计算管道,根据微生物基因的亚基因组特性(如流行率和丰度)对其进行优先排序。然后,可以使用我们的可视化工具进一步分析得到的基因候选的优先顺序列表。ppanini根据亚基因组数据中存在的缺失和丰度来确定微生物群落中重要基因的优先顺序。对一个亚基因组进行测序通常会产生数百万个短的dna/rna读取。ppanini为一项研究中的所有样本提取了一个基因丰度表,它对重要基因进行排序