单细胞rna测序标记选择包
picturedrocks的Python项目详细描述
picturedrocks单单元分析工具
picturedrocks是一个实现信息论特征选择算法的python包。
用法
要安装最新版本的github picturedrocks,请执行picturedrocks的“可编辑”安装:
git clone git@github.com:umangv/picturedrocks.git
cd picturedrocks
pip install -e .
picturedrock与scanpy
兼容,并使用其AnnData
对象。大多数方法都需要加载集群标签。
frompicturedrocks.readimportread_clusts,process_clustsadata=read_clusts(adata,"clust_labels.csv")adata=process_clusts(adata)
可以在online documentation上找到更详细的信息。
代码样式
欢迎拉取请求。请使用numpy-style docstrings并用black格式化代码。
版权所有
版权所有©2017-2019 Umang Varma,Anna Gilbert
picturedrocks是免费软件:您可以重新分发和/或修改它 根据由 自由软件基金会,或者许可证的第3版,或者 (由您选择)任何更高版本。
picturedrocks的发布是希望它能有用, 但没有任何保证;甚至没有 适销性或适合某一特定目的的适销性。见 GNU通用公共许可证了解更多详细信息。
你应该收到GNU通用公共许可证的副本 以及图片中的岩石。如果没有,请参阅http://www.gnu.org/licenses/。