多组分模块相关分析(MOCA)管道版本1.1

moca-p的Python项目详细描述


MOCA

moca(multimics modulecorrelationaa nalysis)是一个综合使用共表达式的python工具。 模块分析和稀疏典型相关分析,以识别模块,即高度 组学水平内部和之间的相关性。

moca是在python 2.7之上构建的,在不久的将来将与python 3.7兼容。

MOCA在GNU Lesser General Public License v3.0下发布。

安装

使用Docker

docker pull albertaki/jupyter-lab:0.35.4-moca

使用pip:

pip install moca-py

使用pipenv:

pipenv install moca-py

依赖关系

请注意,不需要手动安装python依赖项。

对于pip和pipenv用户,请安装以下r依赖项。

  • R(>;=3.4.4)
  • 动态脑电图
  • rgcca
  • 快速群集

更改日志

1.1版(beta版)

  • 为cca添加基于示例对齐的集成
  • 为cca添加硬(子空间不相交)通货紧缩策略
  • 添加不同部件号的CCA加载表集成
  • 添加共同表达式模块差异分析
  • 添加ID映射
  • 为管道添加绘图
  • 添加jupyterlab笔记本
  • 添加文档
  • 添加Docker图像

文档

github页:https://akialbert.github.io/Moca/

引文

待添加

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