单细胞rna序列数据的快速可扩展差异表达分析

diffxp的Python项目详细描述


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单细胞rna序列数据的快速可扩展差异表达分析

diffxpy涵盖了在单细胞rna序列中遇到的一系列差异表达分析方案。 并集成到稀疏的工作流中。 将diffxpy导入为import diffxpy.api as de,以访问以下与差分表达式分析相关的工具:

  1. differential expression analysis在模块中de.test.*
  2. 基于模块中的差异表达调用的基因集富集分析de.enrich.*

有关这些模块的详细信息,请参阅文档和教程。

。_稀疏的:https://github.com/theislab/scanpy ……_文档:https://diffxpy.rtfd.io/en/latest ……_教程:https://diffxpy.rtfd.io/en/latest/tutorials.html

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