dicom-anonymizer 1.0.7

双氰胺

匿名DICOM文件的Python包。 标准的匿名化答案。有关匿名dicom字段的详细信息，请参阅here。在

此包的默认行为是匿名dicomfields中引用的DICOM字段。在

Dicom字段被分成不同的组。每个小组将以不同的方式匿名。在

Group	Action	Action definition
D_TAGS	replace	Replace with a non-zero length value that may be a dummy value and consistent with the VR**
Z_TAGS	empty	Replace with a zero length value, or a non-zero length value that may be a dummy value and consistent with the VR**
X_TAGS	delete	Completely remove the tag
U_TAGS	replaceUID	Replace all UID's number with a random one in order to keep consistent. Same UID will have the same replaced value
Z_D_TAGS	emptyOrReplace	Replace with a non-zero length value that may be a dummy value and consistent with the VR**
X_Z_TAGS	deleteOrEmpty	Replace with a zero length value, or a non-zero length value that may be a dummy value and consistent with the VR**
X_D_TAGS	deleteOrReplace	Replace with a non-zero length value that may be a dummy value and consistent with the VR**
X_Z_D_TAGS	deleteOrEmptyOrReplace	Replace with a non-zero length value that may be a dummy value and consistent with the VR**
X_Z_U_STAR_TAGS	deleteOrEmptyOrReplaceUID	If it's a UID, then all numbers are randomly replaced. Else, replace with a zero length value, or a non-zero length value that may be a dummy value and consistent with the VR**
ALL_TAGS		Contains all previous defined tags

如何建造它？在

源文件可以使用以下方法打包： python .\setup.py bdist_wheel

此命令将在dist文件夹中生成一个wheel包，然后可以使用 pip install .\dist\DicomAnonymizer-0.0.1-py2.py3-none-any.whl

安装此软件包还将安装名为dicom-anonymizer的可执行文件。为了使用它，请参考下一节。在

如何使用它？在

此软件包允许匿名选择DICOM字段（已定义或已覆盖）。 DICOM字段如何匿名的方法也可以被覆盖。在

• [required]InputPath=单个DICOM映像或包含DICOM文件的文件夹的完整路径
• [required]OutputPath=匿名DICOM映像或文件夹的完整路径。此文件夹必须存在。在
• [可选]ActionName=定义了一个将应用于DICOM标记的操作名称。在
• [可选]Dictionary=JSON文件的路径，该文件定义将应用于特定dicom标记的操作（见下文）

违约行为

您可以使用上面描述的默认匿名行为。在

dicom-anonymizerInputOutput

自定义规则

您可以手动添加新规则，以便对某些标记具有不同的行为。 这将允许您覆盖默认规则：

可执行文件：

^{pr2}$

这将把ActionName应用于标记'(0x0001, 0x0001)'，并将{}应用到'(0x0001, 0x0005)'

Note：ActionName必须在actions list中定义

例1：患者ID的默认行为是用空值或空值替换。如果要保留此值，则必须运行：

pythonanonymizer.pyInputFilePathOutputFilePath-t'(0x0010, 0x0020)'keep

此命令将覆盖对此标记执行的默认行为，并保留患者的ID。在

示例2：我们只想将研究日期从20080701更改为20080000，然后使用regexp

pythonanonymizer.pyInputFilePathOutputFilePath-t'(0x0008, 0x0020)''regexp''0701$''0000'

带词典文件的自定义规则

您可以通过创建一个json文件dictionary.json来创建自己的字典，而不是使用一个大的命令行来执行几个新操作：

{"(0x0002, 0x0002)":"ActionName","(0x0003, 0x0003)":"ActionName","(0x0004, 0x0004)":"ActionName","(0x0005, 0x0005)":"ActionName"}

与之前一样，必须在actions list中定义ActionName。在

dicom-anonymizerInputFilePathOutputFilePath--dictionarydictionary.json

如果要在字典中使用regexp操作：

{"(0x0002, 0x0002)":"ActionName","(0x0008, 0x0020)":{"action":"regexp","find":"0701$","replace":"0000"}}

自定义/覆盖操作

下面是一个小示例，它保留了所有元数据，但更新了序列描述 通过添加作为参数传递的后缀。在

importargparsefromdicomanonymizerimport*defmain():parser=argparse.ArgumentParser(add_help=True)parser.add_argument('input',help='Path to the input dicom file or input directory which contains dicom files')parser.add_argument('output',help='Path to the output dicom file or output directory which will contains dicom files')parser.add_argument('--suffix',action='store',help='Suffix that will be added at the end of series description')args=parser.parse_args()input_dicom_path=args.inputoutput_dicom_path=args.outputextraAnonymizationRules={}defsetupSeriesDescription(dataset,tag):element=dataset.get(tag)ifelementisnotNone:element.value=element.value+'-'+args.suffix# ALL_TAGS variable is defined on file dicomfields.py# the 'keep' method is already defined into the dicom-anonymizer# It will overrides the default behaviourforiinallTags:extraAnonymizationRules[i]=keepifargs.suffix:extraAnonymizationRules[(0x0008,0x103E)]=setupSeriesDescription# Launch the anonymizationanonymize(input_dicom_path,output_dicom_path,extraAnonymizationRules)if__name__=="__main__":main()

在您自己的文件中，您必须定义：

• 你的自定义函数。请小心，您的函数总是在输入中包含一个数据集和一个标记
• 将函数映射到标记的字典

不使用dicom文件匿名dicom标记

如果出于某种原因，您需要匿名dicom字段而不需要初始dicom文件（例如从数据库中提取）。以下是如何做到这一点：

fromdicomanonymizerimport*defmain():# Create a list of tags object that should contains id, type and valuefields=[{# Replaced by Anonymized'id':(0x0040,0xA123),'type':'LO','value':'Annie de la Fontaine',},{# Replaced with empty value'id':(0x0008,0x0050),'type':'TM','value':'bar',},{# Deleted'id':(0x0018,0x4000),'type':'VR','value':'foo',}]# Create a readable dataset for pydicomdata=pydicom.Dataset()# Add each field into the datasetforfieldinfields:data.add_new(field['id'],field['type'],field['value'])anonymizeDataset(data)if__name__=="__main__":main()

有关pydicom数据集的更多信息，请参考here。 您也可以像以前一样添加措辞：

dictionary={}defnewMethod(dataset,tag):element=dataset.get(tag)ifelementisnotNone:element.value=element.value+'- generated with new method'dictionary[(0x0008,0x103E)]=newMethodanonymizeDataset(data,dictionary)

操作列表

^{tb2}$

**VR：价值表征

最初由埃德恩·豪蒙特完成的工作

标签：

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