在html文件中创建fastqc输出摘要
bbcu.fastqcReports的Python项目详细描述
python版本
此项目当前正在使用Python2.7
安装
建议使用virtualenv创建干净的python环境。
要安装FastQC报告,请使用pip:
pip install bbcu.fastqcReports
测试
要运行单元测试,请使用:
nosetests
或:
tox
此套件包括单元测试和更耗时的集成测试
执行
此项目附带的主脚本是blast on fastqc.py,请通过运行查看其选项:
blast-on-fastqc.py -h