巴姆2FPKC

bam2fpkc的Python项目详细描述


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概述

它将找到映射到存储箱中所有contig的读取数中值。
映射到任何contig的片段数被标准化为contig长度,以给出每1000个contig或..北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京;北京一组异常,如果您只需要遇到并运行,如果您只需要几个异常exceptions.pkc值包含或a
容器中所有容器的中值fpkc。


容器:
选项在不断变化,请使用:

br这是一个以制表符分隔的文件,格式为



当前,cid必须与fasta文件中的contig头完全匹配,并且必须考虑所有cid。也就是说,未绑定的contig应分配给bin 0
或其他合理的分配。


否则使用:


bam2fpkc bin-h
获取信息……
>请参见http://github.com/minillinim/bam2fpkc
此软件当前未发布。有关引用此软件的详细信息,请与我联系,地址是:澳大利亚的Dot U Imelfort。版权所有:2013 Michael Imelfort。有关详细信息,请参见license.txt。

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