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关于agc 相关联的Python项目和问题：

我试图读取一个包含序列和模式的文本文件 agcdttagcdtcc公司自动增益控制并按顺序计算agc的频率 import sys def pattern_count(text, pattern) ...

2024-09-28 已阅读: n次

我使用字符串编辑距离（Levenshtein距离）来比较眼睛跟踪实验的扫描路径。（现在我正在使用R中的stringdist包）基本上，字符串的字母是指6x4矩阵中的（凝视）位置。矩阵配置如下： ...

2024-09-28 已阅读: n次

我正在尝试将蛋白质序列转换成DNA，但我不知道怎么做。我看到了很多关于如何解决DNA转化为蛋白质的问题的例子，而不是相反的问题 "AAA":"K", "AAC":"N", "ACA":"T", ...

2024-09-28 已阅读: n次

我有一个函数，它将numpy ndarray中表示的图像作为参数。此nArray包含一个列表x列表x列表项（行x像素x像素），需要以常规列表格式转换为列表x列表x元组（因此不再是ndarray）。在 ...

2024-09-28 已阅读: n次

我正在解决一个DNA序列的模式匹配问题，汉明距离达d。Regex救了我一命。但现在我遇到了另一个问题。给定一个长的DNA序列，我必须找到最常见的错配k-mer，最多有d个错配。这里，k-mer指长度k ...

2024-09-28 已阅读: n次

我有一根没有空间的绳子。在 ATG AGC TAA CTC AGG TGA TGG GGA ATG CCC CGC TAA 我需要提取ATG和以TAG|TGA|TAA结尾的字符串（不应包括结尾） ...

2024-09-28 已阅读: n次

有没有人知道如何从与Biopython的多重校准（斯德哥尔摩，Rfam）中恢复SS_cons？文件作为AlignIO对象读入。我要导入具有以下格式的多重对齐（1990序列）： BAAY01001440 ...

2024-09-28 已阅读: n次

我会试着问一些具体的问题这里：在我用python来研究一些相对基本的DSP，我想实现自动增益控制。除非我弄错了，否则采用（简化）形式：我不太关心输入/输出信号之间的相移，输入信号是由缓慢变化的波 ...

2024-09-28 已阅读: n次

我这里有一个每个密码子的分布：“AAA”，“AAC”等，用代表氨基酸的字母表示发行版在词典中排列。如何创建包含64个密码子的分布的直方图？你知道吗 [['AAA', {'R': 3, 'I': ...

2024-09-28 已阅读: n次

我有一个包含所有密码子和氨基酸的txt文件，如下所示： CTT L ATG M ACA T ACG T ATC I AAC N ATA I AGG R CCT P ACT T AGC S AAG K ...

2024-09-28 已阅读: n次

这个问题跟在问题后面：How to read two lines from a file and create dynamics keys in a for-loop? 但是，这个问题的性质已经发展到 ...

2024-09-28 已阅读: n次

我从微波电路中得到一个中频信号，如下所示：我们可以看到，有一个明显的不需要的振幅调制，这被认为是由于天线之间的耦合。此信号也将具有调频调制。在我想去掉这个调幅，这样只剩下调频调制。我要的是载波信 ...

2024-09-28 已阅读: n次