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Python cytoscape
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最新问答
我有一个数据框,我想用它创建一个网络,使用Cytoscape进行可视化。数据帧具有节点、边和权重列
Nodes Edges Weights
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我试着在jupyter笔记本上运行dash,但应用程序没有启动。我得到SystemExit:1错误。请帮忙。我不是要求运行在笔记本,但只是要启动网络应用程序。如果我使用应用程序副本文件,它运行,但为什 ...
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我一直试图在networkx gml中解析一些附加属性,以便以后使用,但遇到了一个问题。在
当从Cytoscape获得gml文件时,networkx输出它自己无法读取的gml文件。在
即Cytosca ...
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我想使用networkx生成图形的布局。是否可以将此布局转移到cytoscape并在那里绘制?我试着简单地写一个图表
import networkx as nx
G = nx.Graph()
G.ad ...
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我有超过50k个节点的数据集,我正试图从中提取可能的边缘和社区。我确实尝试过使用一些图形工具,如gephi、cytoscape、socnet、nodexl等来可视化和识别边缘和社区,但是节点列表对于这 ...
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我正在使用dash cytoscape绘制一个树形图。我希望能够使用短划线回调更新终端节点的样式。我可以让回调函数运行并输出更新的样式,但是图形没有更新,我猜这是因为使用了diffing方法。我已经尝 ...
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我试图使用Cytoscape实现的大小为~500x500的邻接矩阵在Dash上可视化一个网络。我正在将矩阵转换为库使用的专有输入列表样式。我在字典字典上执行此操作的代码表示邻接矩阵,如下所示:
def ...
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我试着用python2的py2cytoscape。在
from py2cytoscape import cyrest
cytoscape=cyrest.cyclient()
cytoscape.sta ...
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所以我有一个python脚本,可以生成networkx图形并将其导出为.graphml,我希望脚本也能够在加载网络的情况下打开cytoscape,而无需对用户进行任何操作。我明白:
cytoscape ...
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我是python中dash cytoscape的新手,我正在尝试对节点(https://github.com/plotly/dash-cytoscape/blob/master/demos/usage ...
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我正在实现一个flask应用程序,我希望在它上面有cytoscape图。我还希望通过在flask应用程序上发送RESTAPI调用来动态更新数据,并且cytoscape图形根据数据更新图形
这是我编写的 ...
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我有一个数据帧,格式如下:
P Q R S
A 0 2 1 1
B 2 0 1 1
C 1 1 0 0
D 1 1 0 0
我想把它改成以下形式:
^{p ...
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最新项目
Pycyrest
简介
连接到cyREST的简单python库。
用法
import pycyrest
client = pycyrest.CyRest()
print(client.operat ...
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用于Jupyter笔记本电脑的cytoscape.js网络可视化小部件 ...
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使用cytoscape.js动态和静态可视化pysb模型 ...
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破折号细胞景观
一个破折号组件库,用于在python中创建交互式和可定制的网络,包装在Cytoscape.js周围。
Medium Article
?Community Announcement
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cytoscape ci的模板工作程序代码。 ...
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cxmate py提供了一个python sdk,用于与[cxmate](https://github.com/ericsage/cxmate)交互,这是一个允许cytoscape与网络服务对话的适配 ...
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使用python中的cytoscape和cytoscape.js的工具集合。从v0.4.0开始,它包括cyrest rest api的包装器。 ...
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使用cytoscape和 ...
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amatreader cytoscape应用程序的python接口
此包Python名称:pyCyAMatReader
目前版本: pyCyAMat ...
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