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Python genotype
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最新问答
我需要读入大量的.txt文件，每个文件都包含一个十进制数（有些是正的，有些是负的），然后将它们附加到2个数组中（基因型和表型）。随后，我希望在scipy中对这些数组执行一些数学运算，但是负（'-'）符 ...
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在制作遗传算法时，我有一个Individu类：
class Individu:
genotype: List[int]
code: List[int]
phenotype: List[Li ...
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也就是说，我们给出了一个双因子（M）方差分析设计，即抽样设计由两个分类变量组成，两个分类变量分别有两个和三个水平，一个维度为4。我们还假设数据以宽幅格式给出，前两个变量描述设计，后四个变量描述响应。（ ...
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你好
我想创建一个python程序，将FCV file、window和increment value作为输入，并在每个窗口中为所有样本（列）返回一个图，其中包含SNP密度下面的示例图像。
我希 ...
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我有一个多索引数据帧，我想在其中放置一个名为AB的二级列。这个二级列的值应该等于每个样本的AD[1]/DP，例如Sample1 AB=60/180
import pandas as pd
import ...
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我想用csv.DictReader要读取一列并根据下面的值，我想打印另一列中相应值之间的差异：value below-上面的值。在
我写了这个剧本：
import csv
next=None
las ...
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我正在学习python并尝试用模拟退火实现一个遗传算法。我创建了一个类来描述我的群体，它包含一个个体列表以及一些其他属性和方法。当我尝试创建下一代群体时，我想从我的群体中去除父母的基因型，然后进行模拟 ...
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line = line.strip()
rsid, chromosome, position, genotype = line.split(",")
它给了我一个值错误
ValueError: N ...
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我想比较23andme的一些基因组序列原始数据，并使用Python进行比较
我已按如下方式导入我的数据：
import pandas as pd
import os
sample_1 = pd.re ...
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我有一个包含基因的“基因型”。这些基因所代表的并不重要，它们只是任意的对象，都可以被称为“基因对象”。在
我需要通过几种方法使这个基因突变，但是并不是所有的功能特征都匹配。给定一个起始基因，一个新的基 ...
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我有一个多索引Pandas数据帧，如下所示：
import pandas as pd
import numpy as np
genotype_data = [
...
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我正在尝试对字符串进行排序（为punnetsquare生成一个基因型）。
我目前的实施是：
unsorted_genotype = 'ABaB'
sorted_genotype = sorted(li ...
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最新项目
请参阅https://github.com/Guardiome/genotype_to_phenotype了解更多信息。 ...
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#基因型网络
wagner（2014）[http://rspb.royalsocietypublishing.org/content/281/1786/20132763]在一篇论文中定义了基因型网络。 ...
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<；a href=“https://github.com/Clinical Genomics/genotype”>；<；img width=“240px”height=“180px” ...
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pyquasar_基因型
类星体基因分型的命令行工具。从芯片序列或
ATAC序列数据。
安装
pip3 install pyQuASAR_genotype
或
pip3 install --user ...
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