禁忌提供了一种用于比较不同分析的基因型的自动化管道。
genotype的Python项目详细描述
<；a href=“https://github.com/Clinical Genomics/genotype”>；
<；img width=“240px”height=“180px”src=“artwork/icon.png”/>；
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管理临床基因组学的SNP调用比较该软件包公开了一个cli和一个裸露的web界面，以可视化存储在sqlite数据库中的结果。
弹性豆茎（eb）的用途：“eb”。
1.通过在存储库的根目录中运行“eb init”创建新的应用程序。
2通过运行“eb create genetion”
3创建新环境。在aws控制台的“configuration/software configuration/”下为新环境配置环境变量。
-`sqlalchemy\u database\u uri`：正在使用的数据库的连接uri
-`genelype\u no\u save`：由于eb不提供持久存储，因此不必存储上载的excel书籍。只需将其设置为“是”。
4在本地安装“genelype”，并使用相同的连接URI运行：`genelype--database[DB-URI]init<；path to SNPs>；`
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