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从pdb-fi得到残基的性质
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<p>我有一个pdb文件,我想用python解析pdb,我想在pdb中找到以下残留物:</p> <pre><code>1. hydrophobicity 2. interface topology 3. solvent accessible surface area </code></pre> <p>我试过用pybel</p> ^{pr2}$ <p>但是,我只能看到一些财产。在</p> <pre><code>'addh', 'atoms', 'calcdesc', 'calcfp', 'charge', 'conformers', 'data', 'dim', 'draw', 'energy', 'exactmass', 'formula', 'localopt', 'make3D', 'molwt', 'removeh', 'spin', 'sssr', 'title', 'unitcell', 'write </code></pre> <p>如何从pdb中找到这3个属性?我可以使用python中可用的任何模块来获取这些属性。在</p>
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1 个回答
匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>正如这个<a href="http://www.biostars.org/p/62967/" rel="nofollow">1</a>答案中提到的,BioPython <a href="http://biopython.org/wiki/Main_Page" rel="nofollow">2</a>为解析<code>.pdb</code>文件提供了支持</p>
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