Ubuntu错误-无法从“分数”导入名称“gcd”

Question

我在用Ubuntu学习基本的生物信息学。我刚刚使用conda下载了multiqc，但当我想运行multiqc时，它会返回： enter image description here

我很天真，不知道如何解决这个问题。任何帮助都将不胜感激。谢谢

Answer 1

当您有一个过时版本的networkx包时，就会出现这个问题，它是一个多QC依赖项。您可以通过更新此程序包来修复它：

conda install networkx=2.5.1

MultiQC的下一个版本（v1.11）将指定至少需要这个版本的networkx，以确保Python 3.9的兼容性

GitHub问题：跟踪此问题：https://github.com/ewels/MultiQC/issues/1413

Answer 2

我认为gcd在3.9中被转移到了数学包中。见https://docs.python.org/3/library/fractions.html

Changed in version 3.9: The math.gcd() function is now used to normalize the numerator and denominator. math.gcd() always return a int type. Previously, the GCD type depended on numerator and denominator.

我建议您使用3.8创建一个虚拟环境并尝试一下。有很多关于如何做到这一点的教程

Answer 3

正如Andrew所说，Python3.8可以虚拟安装。然而，我刚刚要求Conda重新安装python的旧版本（3.8），现在它工作得很好