Python中差异基因表达分析

Question

看来大多数RNA序列的差异基因表达包都是用R

Examples include:

- edgeR
- limma
- DESeq

Python是否有类似（且易于使用）的包，或者是否移植了R包？在

我能找到的最好的是：

• https://bcbio.wordpress.com/2009/09/13/differential-expression-analysis-with-bioconductor-and-python/
• http://dept.stat.lsa.umich.edu/~kshedden/Python-Workshop/gene_expression_comparison.html

但我真的不想使用rpy2（1st link）。第二个环节可能是我要开始的地方，但我首先想确保我没有重新发明轮子。在