一个小程序包,用于修改xdmf hdf网格中二次三角形和tet的节点顺序,以便与fenics/dolfin一起工作。

xdmf-dolfin-fix的Python项目详细描述


xdmf_dolfin_fix

fenics/dolfin存在xdmf进口问题。二次三角形和四面体 导入错误。cli工具xdmf-dolfin-fix通过重新排序元素编号来解决此问题。

示例用法

xdmf-dolfin-fix old.xdmf            # fix old.xdmf
xdmf-dolfin-fix old.xdmf new.xdmf   # create fixed new.xdmf
xdmf-dolfin-fix old.geo -d3         # create fixed old.xdmf from gmsh
xdmf-dolfin-fix old.msh new.xdmf    # create fixed new.xdmf from gmsh

问题

在模拟的某个点上,fenics/dolfin命令所有元素的顶点 按数字顺序排列。元素边缘的节点 在二次三角形和二次四面体中——不交换。

所以在内部,任意二次四面体的节点数

[ vertices |    edges   ]
[ 51 74 12 | 14 72 1003 ]

将重新排序为

[ 12 51 74 | 14 72 1003 ]

现在,顶点节点[12 51 74]被排序,但是边节点[14 72 1003] 保持不变。这将导致扭曲的几何体。

修复

xdmf-dolfin-fix对顶点节点排序,并相应地对边节点重新排序。这个 将导致

[ 12 51 74 | 1003 14 74 ]

在dolfin中进一步排序没有效果,因此不会弄乱 这个命令。

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