在python中使用摆动轨迹
wiggelen的Python项目详细描述
wiggelen是一个python库,用于处理wiggle轨迹(wig文件)。它 还为其某些功能提供了命令行界面。
Wiggelen的主要目标是提供轻量级和统一的访问 摆动轨迹。
>>> importwiggelen>>> forxinwiggelen.walk(open('test.wig')):... print'chr%s:%d\t%s'%x...chr18:34344 629.0 chr18:34345 649.0 chr18:34446 657.0 chrM:308 520.0 chrM:309 519.0
使用pip通过pypi安装最新版本:
pip install wiggelen
文档
带用户指南的latest documentation api引用托管在read the docs。
您也可以直接从源代码编译文档,方法是 从doc/子目录运行make html。这需要Sphinx 待安装。
版权所有
Wiggelen是根据麻省理工学院的许可证授权的,请参阅 细节。有关作者列表,请参见作者文件。