在python中使用摆动轨迹

wiggelen的Python项目详细描述


wiggelen是一个python库,用于处理wiggle轨迹(wig文件)。它 还为其某些功能提供了命令行界面。

Wiggelen的主要目标是提供轻量级和统一的访问 摆动轨迹。

>>> importwiggelen>>> forxinwiggelen.walk(open('test.wig')):... print'chr%s:%d\t%s'%x...chr18:34344  629.0
chr18:34345  649.0
chr18:34446  657.0
chrM:308     520.0
chrM:309     519.0

使用pip通过pypi安装最新版本:

pip install wiggelen

文档

带用户指南的latest documentation api引用托管在read the docs。

您也可以直接从源代码编译文档,方法是 从doc/子目录运行make html。这需要Sphinx 待安装。

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