未提供项目说明
protfasta的Python项目详细描述
普罗法斯塔
0.1.3版
概述
protfasta-一个健壮的基于蛋白质的FASTA文件解析器。在
文件
有关所有文档,请参阅https://protfasta.readthedocs.io/en/latest/。在
有关代码,请参见https://github.com/holehouse-lab/protfasta。在
安装
protfasta
已经在Linux和macOS上进行了测试。它也可以在Windows上运行,但我们还没有在那里进行测试。在
protfasta
可以使用pip直接从PyPI下载并安装:
pip install protfasta
如果这是有效的,pfasta
命令行工具应该可以从命令行获得
你就完蛋了。这也意味着您现在可以import
并在Python工作流中使用^{str1}$protfasta。在
简单的例子
import protfasta
# sequences is now a dictionary where keys are FASTA headers and values are sequences.
sequences = protfasta.read_fasta('inputfile.fasta')
错误和帮助
对于错误报告或错误,请在此github存储库中提出问题(请参阅顶部的Issues选项卡)。在
版权所有
版权所有(c)2020,Alex Holehouse-Holehouse lab。protfasta
是在麻省理工学院许可下发布的。代码库结构良好且相对简单,可用于功能添加。我们欢迎pull请求,假设贡献的代码保持了适当级别的清晰性和健壮性。在
致谢
在protfasta
开发中使用的许多软件工程工具和方法都来自Molecular Sciences Software Institute开发的资源。在
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