未提供项目说明

protfasta的Python项目详细描述


普罗法斯塔

Build Status

0.1.3版

概述

protfasta-一个健壮的基于蛋白质的FASTA文件解析器。在

文件

有关所有文档,请参阅https://protfasta.readthedocs.io/en/latest/。在

有关代码,请参见https://github.com/holehouse-lab/protfasta。在

安装

protfasta已经在Linux和macOS上进行了测试。它也可以在Windows上运行,但我们还没有在那里进行测试。在

protfasta可以使用pip直接从PyPI下载并安装:

pip install protfasta

如果这是有效的,pfasta命令行工具应该可以从命令行获得

^{pr2}$

你就完蛋了。这也意味着您现在可以import并在Python工作流中使用^{str1}$protfasta。在

简单的例子

import protfasta

# sequences is now a dictionary where keys are FASTA headers and values are sequences.
sequences = protfasta.read_fasta('inputfile.fasta')

错误和帮助

对于错误报告或错误,请在此github存储库中提出问题(请参阅顶部的Issues选项卡)。在

版权所有

版权所有(c)2020,Alex Holehouse-Holehouse labprotfasta是在麻省理工学院许可下发布的。代码库结构良好且相对简单,可用于功能添加。我们欢迎pull请求,假设贡献的代码保持了适当级别的清晰性和健壮性。在

致谢

protfasta开发中使用的许多软件工程工具和方法都来自Molecular Sciences Software Institute开发的资源。在

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

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