参数化计算机断层成像模拟器
tomograph的Python项目详细描述
断层摄影-参数化计算机断层摄影模拟器
tomograph是一个参数化的计算机断层成像模拟器，它可以作为
一个独立的脚本或作为模块包含在python程序中。它
实现radon和reverse radon转换。它目前有两种型号
光束投影类型：圆锥和平行。
依赖关系
当前tomograph需要：
- 单击（
click） - tqdm（
tqdm） - numpy（
numpy） - 图像处理科学工具包（
scikit-image）
它们各自所需的版本可以在requirements.txt文件中看到。
安装
只需运行：
pip install tomograph
tomograph支持python 3.5、python3.6和python3.7。
用法
tomograph可以直接通过命令行界面使用，也可以作为python使用
模块：
命令行
使用命令行界面：
tomograph --model cone --detectors 256 --angle 150 --rotations 512 image.jpg
所有命令行参数都可以通过运行：
tomograph --help
模块
使用锥束模型进行radon变换的示例脚本：
from skimage.io import imsave
from tomograph.model import ConeTomograph
# variables
path = 'image.jpg'
detectors = 256
angle = 180
rotations = 512
# one scan per rotation
step = 360 / rotations
# perform Radon transform
tomograph = ConeTomograph(path, detectors, angle)
sinogram = []
for i in range(rotations):
tomograph.rotate(step) # rotate tomograph
scan = tomograph.scan() # do the scan
sinogram.append(scan)
imsave('radon.bmp', np.array(sinogram).T)
现场演示
| Beam lines | Radon transform | reverse Radon transform |
|---|---|---|
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