sfftk-migrate 0.1.0b7

关于

sfftk-migrate是将EMDB-SFF文件从旧版本迁移到最新版本的数据模型的实用程序 （最新版本见https://emdb-empiar.github.io/EMDB-SFF/）。 它目前只支持从EMDB-SFFv0.7.0.dev0迁移XML（.sff）文件。在

使用

这个实用程序的主要入口点是sff-migrate命令。请使用以下命令查阅命令行帮助：

~$ sff-migrate -h
usage: sff-migrate [-h][-t TARGET_VERSION][-o OUTFILE][-v][-l][-s][infile]

Upgrade EMDB-SFF files to more recent schema

positional arguments:
  infile                input XML file

optional arguments:
  -h, --help            show this help message and exit
  -t TARGET_VERSION, --target-version TARGET_VERSION
                        the target version to migrate to [default: 0.8.0.dev1]
  -o OUTFILE, --outfile OUTFILE
                        outfile file [default: <infile>_<target>.xml]
  -v, --verbose         verbose output [default: False]
  -l, --list-versions   list supported versions [default: False]
  -s, --show-version    show the version of the input file [default: False]

迁移很简单：

~$ sff-migrate -l
versions migratable to 0.8.0.dev1:
* 0.7.0.dev0

~$ sff-migrate -s sfftk_migrate/data/xml/emd_1547.sff
file sfftk_migrate/data/xml/emd_1547.sff is of version 0.7.0.dev0

~$ sff-migrate -s sfftk_migrate/data/xml/emd_1547_v0.8.0.dev1.sff
file sfftk_migrate/data/xml/emd_1547_v0.8.0.dev1.sff is of version v0.8.0.dev0

许可证

sfftk-migrate是根据Apache许可条款发布的免费开源软件， 版本2.0。源代码版权所有EMBL欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）2020。在

源代码可从Github存储库获得： https://github.com/emdb-empiar/sfftk-migrate