神经成像工具和数据之间的一个简单层
seam的Python项目详细描述
Seam是标准神经成像工具和数据之间的一个简单层。它围绕这些工具生成有用的命令,这样您就可以将它们应用于您的数据。
seam不会对数据的组织或生成的命令的最终执行方式做出任何决定。这取决于您作为科学家和工程师的身份。
` probtrackx2`.
-其他贡献或确定有用的
理念
----
软件最好分层编写。每一层都应该封装关于如何最好地使用下一层的知识。它的功能应该通过尽可能简单的api来公开。
seam将没有依赖关系,使用它所需的工作也将是最少的。它应该集成到任何应用程序中,从单个脚本到更复杂的应用程序。
“sub003”:“/path/to/third/t1.nii”}
对于subject-id,path-to-T1在subject-data.iteritems():
recon-u command=recon-all(input=path-to-u-t1)
script-u-name='recon-u{}.sh”。使用open(script-name,“w”)作为f:
f.write(recon_command)
```
它通过[范德比尔特大学成像科学研究所][1]得到支持。请使用github解决问题,但我不能保证支持。
[1]:http://vuiis.vanderbilt.edu
seam不会对数据的组织或生成的命令的最终执行方式做出任何决定。这取决于您作为科学家和工程师的身份。
` probtrackx2`.
-其他贡献或确定有用的
理念
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软件最好分层编写。每一层都应该封装关于如何最好地使用下一层的知识。它的功能应该通过尽可能简单的api来公开。
seam将没有依赖关系,使用它所需的工作也将是最少的。它应该集成到任何应用程序中,从单个脚本到更复杂的应用程序。
“sub003”:“/path/to/third/t1.nii”}
对于subject-id,path-to-T1在subject-data.iteritems():
recon-u command=recon-all(input=path-to-u-t1)
script-u-name='recon-u{}.sh”。使用open(script-name,“w”)作为f:
f.write(recon_command)
```
它通过[范德比尔特大学成像科学研究所][1]得到支持。请使用github解决问题,但我不能保证支持。
[1]:http://vuiis.vanderbilt.edu