scipion-em-gautomatch 1.0.7

安装

您需要使用2.0版本的scipion才能运行这些协议。要安装插件，有两个选项：

1. 稳定版本

   scipion installp -p scipion-em-gautomatch
   

2. 开发人员版本

   • 下载存储库

   git clone https://github.com/scipion-em/scipion-em-gautomatch.git
   

   • 安装

   scipion installp -p path_to_scipion-em-gautomatch --devel
   

GoMutualCH二进制文件将自动安装在插件中，但您也可以链接现有的安装。 假定默认安装路径为software/em/gautomatch-0.56，如果要更改该路径，请将scipion.conf文件中的gautomatch_home设置为安装gautomatch的文件夹。根据CUDA版本和GPU卡计算能力，您可能希望通过显式设置gautomatch变量将默认二进制文件从Gautomatch_v0.56_sm60_cu8.0更改为其他二进制文件。如果需要使用不同于scipion安装期间使用的cuda（由cuda-lib定义），可以将gautomatch-cuda-lib变量添加到配置文件中。各种二进制文件可以从Gautomatch官方网站下载。

要检查安装，只需运行以下scipion测试： scipion test gautomatch.tests.test_protocols_gautomatch.TestGautomatchAutomaticPicking

支持的版本

0.53和0.56

协议

• auto-picking

参考文献

1. 张凯。未发布。