处理原子结构文件的scipion插件(pdb/mmcif)
scipion-em-atomstructutils的Python项目详细描述
Atom结构实用工具scipion插件
处理pdb/mmcif原子结构文件的实用程序:
当前插件实用程序:
- 从原子结构中提取链(pdb/cif文件)
- 执行多个原子结构的并集
在名为“操作”的单一协议中实现
安装此插件
您需要使用2.0.0版本的scipion来运行这些协议。要安装插件,有两个选项:
- 稳定版本
scipion installp -p scipion-em-atom_struct_utils
或
- through the plugin manager GUI by launching Scipion and following Configuration >> Plugins
- 开发者版本
- 下载存储库:
git clone https://github.com/scipion-em/scipion-em-atom_struct_utils.git
- 安装:
scipion installp -p path_to_scipion-em-atom_struct_utils --devel
- 二进制文件
atom_struct_utils插件是一个纯python模块,不需要二进制文件。
- 测试
- 要检查安装,只需运行以下scipion测试:
- scipion测试–grep testoperate–运行
- scipion测试–grep testconvertsymetry–运行
buildbot状态
状态开发版本:
状态生产版本: