斜焰动力学和同位素分析

rampedpyrox的Python项目详细描述


关于RampedPyrox

rampedpyrox是一个python包,用于分析实验动力学数据和附带的化学/同位素组成信息。rampedpyrox特别适用于分析斜坡温度仪器的结果,例如斜坡焦磷酸盐、火箭、热解气相色谱(pygc)、热肉汁试验(tga)等。该软件包使用选择的反应连续介质模型将时间序列质量观测值转换为速率/活化能(e)分布,包括非等温数据的分布活化能模型(daem)。此外,该软件包还将模拟的速率/e数据与测量的同位素组成数据关联起来,并在适当的情况下对动力学分馏的同位素进行校正。

这个包是作为J.D.海明威博士论文的一个补充,该论文由麻省理工学院/世界卫生组织海洋学联合项目(2017年2月)授予。

包裹信息

Authors:Jordon D. Hemingway (jordon_hemingway@harvard.edu)
Version:1.0.2
Release:5 November 2018
License:GNU GPL v3 (or greater)
url:http://github.com/FluvialSeds/rampedpyroxhttp://pypi.python.org/pypi/rampedpyrox
doi:doi

如何引用

当使用rampedpyrox分析数据以用于同行评审时 Journal,请将此程序包引用为:

此外,请引用以下同行评议的手稿,描述软件包的开发和斜坡Pyrox数据处理:

  • J.D.海明威等人(2017)用串联氧化法实现有机碳反应与同位素组成的逆模型。生物地球科学讨论综述

如果使用由nosams仪器生成的倾斜pyrox数据,则以下手稿包含有关空白碳成分、同位素质量平衡和动力学同位素效应大小的相关信息:

  • J.D.海明威等人(2017)对NOSAMS斜坡热解/氧化装置的空白碳贡献、同位素质量平衡和动力学同位素分馏进行了评价。放射性碳59,179-193。

文件

最新版本的文档,包括详细的包引用以及分析斜坡Pyrox数据的全面演练,可在以下位置获得:

http://rampedpyrox.readthedocs.io

套餐功能

rampedpyrox目前包含以下与非等温动力学分析相关的特性:

  • 存储和绘制热图数据
  • 执行一阶DAEM逆模型以估计活化能分布,p(0,e)
    • 使用tikhonov正则化对p(0,e)进行正则化(“平滑”)。
    • 自动或用户定义的正则化值
  • 计算每个rpo集合分数中p(0,e)的子集
    • 自动空白使用任何已知的空白碳组成校正输入的同位素值
    • 校正加热过程中动力学同位素效应(kie)的测量值13c/12c比值
  • 计算并存储模型性能度量和拟合优度 统计
  • 生成每个rpo分数的热谱图、p(0,e)和e与同位素值的关系图
  • 允许对任意时间-温度历史进行正演模拟,例如以确定地质有机碳成熟过程中的分解速率和同位素分馏
  • 未来增加的内容

    未来的rampedpyrox版本将包括:

    • 更好地支持等温实验条件
    • 非一阶动力学模型

    如何获得

    源代码可以直接从github下载:

    http://github.com/FluvialSeds/rampedpyrox

    二进制文件可以通过python包索引安装:

    $ pip install rampedpyrox
    

    许可证

    此产品已获得U许可GNU GPL许可证,3版或更高版本。

    错误报告

    这个软件仍在开发中。请直接向我报告任何错误:

    jordon_hemingway@harvard.edu

    欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

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