通过oqmd api查询oqmd数据的python代码
qmpy-rester的Python项目详细描述
qmpy_rester
通过oqmd api（PyPI）查询oqmd数据的python代码。这段代码是用python 3编写的。
安装
pip install qmpy_rester
用法
一。通过omqd api获取数据
1.1示例
import qmpy_rester as qr
## Return list of data
with qr.QMPYRester() as q:
kwargs = {
‘element_set’: ‘(Fe-Mn),O’, # composition include (Fe OR Mn) AND O
‘stability’: ‘<-0.1’, # hull distance smaller than -0.1 eV
‘natom’: ‘<10’, # number of atoms less than 10
}
list_of_data = q.get_oqmd_phases(**kwargs)
## Return data of a single oqmd phase
with qr.QMPYRester() as q:
phase = q.get_oqmd_phase_by_id(fe_id=4061139, fields='!sites') # Default: fields=None
1.2允许的属性
composition：材料或相空间的合成，例如，Al2O3、Fe-Oelement_set：化合物必须具有的元素集合，例如（fe-mn），oprototype：该化合物的结构原型，如cu，csclgeneric：化学式摘要，例如ab，ab2spacegroup：结构的空间群，例如fm-3mnatoms：超级电池中的原子数，例如2，>；5volume：超级电池的体积，例如>；10ntypes：化合物中元素类型的数目，例如2，<；3stability：化合物的外壳距离，例如0，<；-0.1，delta_e：化合物的形成能，例如<；-0.5，band_gap：材料的带隙，例如0，>；2fields：返回字段的子集，例如“name，id，delta”，'！站点'filter：自定义过滤器，例如“element-set=o和（stability<；-0.1或delta-e<；-0.5）”limit：一次返回的数据数offset：数据返回的偏移量
2.通过optimade api格式获取数据
2.1示例
import qmpy_rester as qr
## Return list of data
with qr.QMPYRester() as q:
kwargs = {
‘elements’: ‘Fe,Mn’, # include element Fe and Mn
‘nelements’: ‘<5’, # less than 4 element species in the compound
‘_oqmd_stability’: ‘<0’, # stability calculted by oqmd is less than 0
}
list_of_data = q.get_optimade_structures(**kwargs)
## Return data of a single structure
with qr.QMPYRester() as q:
structure = q.get_optimade_structure_by_id(id=4061139, fields='!_oqmd_sites') # Default: fields=None
1.2允许的属性
elements：化合物必须具有的元素集合，例如si，onelements：化合物中元素类型的数目，例如2，<；3chemical_formula：材料的堆肥，例如氧化铝formula_prototype：化学式摘要，例如ab，ab2_oqmd_natoms：超级电池中的原子数，例如2，>；5_oqmd_volume：超级电池的体积，例如>；10_oqmd_spacegroup：结构的空间群，例如fm-3m_oqmd_prototype：该化合物的结构原型，如cu，cscl_oqmd_stability：化合物的外壳距离，例如0，<；-0.1，_oqmd_delta_e：化合物的形成能，例如<；-0.5，_oqmd_band_gap：材料的带隙，例如0，>；2fields：返回字段的子集，例如“elements，chemical_formula”，'！_ OQMD U站点filter：自定义过滤器，例如“elements=o和（_oqmd_stability<；-0.1或_oqmd_delta_e<；-0.5）limit：一次返回的数据数offset：数据返回的偏移量
import qmpy_rester as qr
## Return list of data
with qr.QMPYRester() as q:
kwargs = {
‘element_set’: ‘(Fe-Mn),O’, # composition include (Fe OR Mn) AND O
‘stability’: ‘<-0.1’, # hull distance smaller than -0.1 eV
‘natom’: ‘<10’, # number of atoms less than 10
}
list_of_data = q.get_oqmd_phases(**kwargs)
## Return data of a single oqmd phase
with qr.QMPYRester() as q:
phase = q.get_oqmd_phase_by_id(fe_id=4061139, fields='!sites') # Default: fields=None
composition：材料或相空间的合成，例如，Al2O3、Fe-Oelement_set：化合物必须具有的元素集合，例如（fe-mn），o
LI> {< CD4> }：ICSD中是否存在结构，如假、真、f、tprototype：该化合物的结构原型，如cu，csclgeneric：化学式摘要，例如ab，ab2spacegroup：结构的空间群，例如fm-3mnatoms：超级电池中的原子数，例如2，>；5volume：超级电池的体积，例如>；10ntypes：化合物中元素类型的数目，例如2，<；3stability：化合物的外壳距离，例如0，<；-0.1，delta_e：化合物的形成能，例如<；-0.5，band_gap：材料的带隙，例如0，>；2fields：返回字段的子集，例如“name，id，delta”，'！站点'filter：自定义过滤器，例如“element-set=o和（stability<；-0.1或delta-e<；-0.5）”limit：一次返回的数据数offset：数据返回的偏移量
2.通过optimade api格式获取数据
2.1示例
import qmpy_rester as qr
## Return list of data
with qr.QMPYRester() as q:
kwargs = {
‘elements’: ‘Fe,Mn’, # include element Fe and Mn
‘nelements’: ‘<5’, # less than 4 element species in the compound
‘_oqmd_stability’: ‘<0’, # stability calculted by oqmd is less than 0
}
list_of_data = q.get_optimade_structures(**kwargs)
## Return data of a single structure
with qr.QMPYRester() as q:
structure = q.get_optimade_structure_by_id(id=4061139, fields='!_oqmd_sites') # Default: fields=None
1.2允许的属性
elements：化合物必须具有的元素集合，例如si，onelements：化合物中元素类型的数目，例如2，<；3chemical_formula：材料的堆肥，例如氧化铝formula_prototype：化学式摘要，例如ab，ab2_oqmd_natoms：超级电池中的原子数，例如2，>；5_oqmd_volume：超级电池的体积，例如>；10_oqmd_spacegroup：结构的空间群，例如fm-3m_oqmd_prototype：该化合物的结构原型，如cu，cscl_oqmd_stability：化合物的外壳距离，例如0，<；-0.1，_oqmd_delta_e：化合物的形成能，例如<；-0.5，_oqmd_band_gap：材料的带隙，例如0，>；2fields：返回字段的子集，例如“elements，chemical_formula”，'！_ OQMD U站点filter：自定义过滤器，例如“elements=o和（_oqmd_stability<；-0.1或_oqmd_delta_e<；-0.5）limit：一次返回的数据数offset：数据返回的偏移量
import qmpy_rester as qr
## Return list of data
with qr.QMPYRester() as q:
kwargs = {
‘elements’: ‘Fe,Mn’, # include element Fe and Mn
‘nelements’: ‘<5’, # less than 4 element species in the compound
‘_oqmd_stability’: ‘<0’, # stability calculted by oqmd is less than 0
}
list_of_data = q.get_optimade_structures(**kwargs)
## Return data of a single structure
with qr.QMPYRester() as q:
structure = q.get_optimade_structure_by_id(id=4061139, fields='!_oqmd_sites') # Default: fields=None
elements：化合物必须具有的元素集合，例如si，onelements：化合物中元素类型的数目，例如2，<；3chemical_formula：材料的堆肥，例如氧化铝formula_prototype：化学式摘要，例如ab，ab2_oqmd_natoms：超级电池中的原子数，例如2，>；5_oqmd_volume：超级电池的体积，例如>；10_oqmd_spacegroup：结构的空间群，例如fm-3m_oqmd_prototype：该化合物的结构原型，如cu，cscl_oqmd_stability：化合物的外壳距离，例如0，<；-0.1，_oqmd_delta_e：化合物的形成能，例如<；-0.5，_oqmd_band_gap：材料的带隙，例如0，>；2fields：返回字段的子集，例如“elements，chemical_formula”，'！_ OQMD U站点filter：自定义过滤器，例如“elements=o和（_oqmd_stability<；-0.1或_oqmd_delta_e<；-0.5）limit：一次返回的数据数offset：数据返回的偏移量
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