吡喃
pysam的Python项目详细描述
pysam-一个用于读取、操作和编写的python模块 基因组数据集。
pysam是htslib c-api的轻量级包装器,它提供 读写SAM/BAM/VCF/BCF/BED/GFF/GTF/FASTA/FASTQ的工具 文件以及对 samtools和bcftools包。该模块支持压缩和 通过索引进行随机访问。
这个模块提供了一个围绕htslib C-API的底层包装器 使用cython和高级API方便地访问数据 在标准基因组文件格式内
见: http://www.htslib.orghttps://github.com/pysam-developers/pysamhttp://pysam.readthedocs.org/en/stable