python磁共振工具
pymrt的Python项目详细描述
pymrt-python磁共振工具
____ __ __ ____ _____ | _ \ _ _| \/ | _ \_ _| | |_) | | | | |\/| | |_) || | | __/| |_| | | | | _ < | | |_| \__, |_| |_|_| \_\|_| |___/
概述
此软件提供基于Python库和辅助控制台的支持 用于执行磁共振成像(MRI)常见任务的工具。 目的是做瑞士军刀的核磁共振成像。
目前,最好支持以下功能:
- 从mri角度进行图像分析的通用工具
- 定量mri实验的数据分析
除此之外,目前正在进行以下工作 区域:
- 图像重建和相关功能(例如线圈组合等)
它相对容易扩展,鼓励用户使用它进行调整。
由于代码的成熟,一些库组件可能会 (最终是沉重的)重构,尽管这是目前意料之外的。
发布信息可通过NEWS.rst获得。
有关更全面的更改列表,请参见CHANGELOG.rst。
安装
建议安装软件的方法是通过 PyPI:
$ pip install pymrt
或者,您可以从 Bitbucket:
$ mkdir pymrt
$ cd pymrt
$ git clone git@bitbucket.org:norok2/pymrt.git
$ python setup.py install
有关详细信息,请参见INSTALL.rst。
许可证
本作品通过 GPLv3+
将本软件用于科学目的,并最终出版 应通过引用以下参考来确认:
metere,R.,穆勒,H.E.,2017年。PYMRT和DCMPI:MRI数据分析的两个新Python包,3816:International Society for Magnetic共振in Medicine(ISMRM)第25届年会和展览记录,美国夏威夷檀香山。
致谢
这个软件是里卡多·梅特尔博士工作的一部分。 Max Planck Institute for Human Cognitive and Brain Sciences和University of Leipzig,并从那里不断扩展。
有关作者的完整列表,请参见AUTHORS.rst。
影响这项工作的人在THANKS.rst中得到承认。
这项工作部分由欧盟资助。 通过第七个框架计划玛丽·居里行动 通过“超高场磁共振成像:HIMR” 初始培训网络(FP7-People-2012-ITN-316716)。