七种ecg心跳检测算法及心率变异性分析
py-ecg-detectors的Python项目详细描述
用python实现的7种ecg心跳检测算法的集合。与新的心电图数据库一起开发的：http://researchdata.gla.ac.uk/716/。这个存储库还包含mitdb和新格拉斯哥大学数据库的测试类。此外，hrv模块还为 分析心率变异性。
安装
Linux/Mac:
pip3 install py-ecg-detectors [--user]
窗口：
pip install py-ecg-detectors [--user]
来源：
python3 setup.py install [--user]
如果您没有系统写入权限，请使用选项–user。
ECG检测器类用法
在使用检测器之前，必须首先使用ECG记录的采样率初始化类：
fromecgdetectorsimportDetectorsdetectors=Detectors(fs)
有关如何使用检测器的示例，请参见usage\example.py。
汉密尔顿
P.S.Hamilton的实施，“开放源码心电图分析软件文档”，E.P.有限公司，2002年。用法：
r_peaks = detectors.hamilton_detector(unfiltered_ecg)
克里斯托夫
Ivaylo I.Christov的实现，“使用组合自适应阈值的实时心电图QRS检测”，生物医学工程在线2004，第3卷：28，2004。用法：
r_peaks = detectors.christov_detector(unfiltered_ecg)
恩格斯和泽伦伯格
W.Engelse和C.Zeelenberg的实现，“qrs检测和特征提取的单扫描算法”，IEEE Comp.《心脏病学》，第6卷，第37-42页，1979年，A.Lourenco，H.Silva，P.Leite，R.Lourenco和A.Fred修改，“基于手指的心电图生物测定的实时心电图分割”，Biosignals 2012，第49-54页，2012年。用法：
r_peaks = detectors.engzee_detector(unfiltered_ecg)
潘和汤普金斯
潘家普和汤普金斯的实现。“实时qrs检测算法”。摘自：生物医学工程ieee汇刊bme-32.3（1985），第230-236页。用法：
r_peaks = detectors.pan_tompkins_detector(unfiltered_ecg)
平稳小波变换
基于Vignesh Kalidas和Lakshman Tamil的实现。“使用平稳小波变换的实时qrs检测器用于自动心电图分析”。在：2017年IEEE17国际生物信息学和生物工程会议（BIBE）。使用pan和tompkins的thresolding方法。用法：
r_peaks = detectors.swt_detector(unfiltered_ecg)
两个移动平均值
Elgendi、Mohamed&Jonkman、Mirjam&de Boer、Friso的实施。（2010年）。“qrs检测的频带效应”，第三届生物激励系统与信号处理国际会议（生物信号2010）。428-431。 用法：
r_peaks = detectors.two_average_detector(unfiltered_ecg)
匹配滤波器
基于qrs复合模板的fir匹配滤波器。提供250Hz和360Hz的模板。使用pan和tompkins的thresolding方法。用法：
r_peaks = detectors.matched_filter_detector(unfiltered_ecg)
心率变异性分析
hrv模块提供了大量心率的集合。 作为类方法的变异性度量
HR(self, rr_samples) Calculate heart-rates from R peak samples. NN20(self, rr_samples) Calculate NN20, the number of pairs of successive NNs that differ by more than 20 ms. NN50(self, rr_samples) Calculate NN50, the number of pairs of successive NNs that differ by more than 50 ms. RMSSD(self, rr_samples, normalise=False) Calculate RMSSD (root mean square of successive differences). SDANN(self, rr_samples, average_period=5.0, normalise=False) Calculate SDANN, the standard deviation of the average RR intervals calculated over short periods. SDNN(self, rr_samples, normalise=False) Calculate SDNN, the standard deviation of NN intervals. SDSD(self, rr_samples) Calculate SDSD (standard deviation of successive differences), the standard deviation of the successive differences between adjacent NNs. fAnalysis(self, rr_samples) Frequency analysis to calc self.lf, self.hf, returns the LF/HF-ratio. pNN20(self, rr_samples) Calculate pNN20, the proportion of NN20 divided by total number of NNs. pNN50(self, rr_samples) Calculate pNN50, the proportion of NN50 divided by total number of NNs.
有关参数和其他信息，请使用python帮助函数：
import hrv help(hrv)
示例计算心率 时间域的可变性。
基准
run_all_benchmarks.py计算r峰值时间戳 对于所有探测器，正确/错误检测/未命中和 将它们保存在.csv文件中。打开脚本本身或使用python的 如何获取mit-db等心电数据的帮助功能。
show_stats_plots.py获取然后显示.csv文件 不同探测器的结果并计算统计数据。
hrv_time_domain_analysis.py执行时域分析 在坐着和用Engzee探测器做数学测试之间 用于比较的小波检测器。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
