噬菌体DNA序列图形化预测工具的研究

phage-commander的Python项目详细描述


噬菌体指挥官

一种图形化的实用程序,用于查询各种基因预测工具以获得FASTA格式的DNA序列。在

概述

噬菌体指挥官提供实用程序来查询各种基因编码预测工具和各种格式的结果。在

目前支持以下基因编码预测工具:

  • 微光
  • 基因标记
  • Genemark嗯
  • 基因标记
  • 基因标记2
  • 基因标记启发式
  • 挥霍的
  • 拉斯特
  • 后基因

支持的导出格式:

  • Genbank公司
  • Excel表格

入门

先决条件

  • Python 3.6+

安装

通过pip安装

pip install phage-commander

通过pip和git安装

^{pr2}$

运行

# on Windows
phagecom.exe
# on MacOS/Linux
phagecom

注意:pip“Scripts”目录应该包含在PATH变量中。在

作者

  • Matthew Lazeroff

许可证

这个项目是在GNU GPLv3下授权的

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