使用padmet和sbml格式管理、探索和连接代谢网络的模块
padmet-utils的Python项目详细描述
作者:Meziane Aite(meziane.aite@inria.fr)
##说明
padmet实用程序的主要概念是提供解决方案,以确保在任何工作流程中使用的信息的一致性、内部标准化和协调,这些工作流程结合了涉及代谢网络重建或分析的多个工具。padmet软件包是aureme工作流程的核心,致力于从原始数据中初步重建基因组规模的代谢网络。它允许对几乎没有实验数据的有机体进行研究。它的主要特点是将多种异构知识和数据源相结合,对代谢网络进行重构,其中包括多个支架代谢网络所报告的近亲物种的信息。
##文档
https://padmet-utils.readthedocs.io/en/latest/