oligotyping 2.1

寡分型

寡分型是一种新的有监督的计算方法 利用非常细微的核苷酸变异在微生物群落中分类 在16s核糖体rna基因扩增子中。它可以显示以前未观察到的 生态模式和隐藏在环境数据集中的多样性。

寡分型，取决于高变区，相似度阈值 不同类型之间可以低至0.2%，比 事实上，otu聚类方法使用的3%相似性阈值。

有关安装和使用说明，请参见项目网页：

• https://meren.github.io/projects/oligotyping/

许可证

此程序是免费软件：您可以重新分发和/或修改 根据由 自由软件基金会，或者许可证的第2版，或者 （由您选择）任何更高版本。

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作者

我是[海洋生物实验室]（约瑟芬）的助理研究科学家。 贝保罗比较分子生物学与进化中心（bay paul center for comparative molecular biology and evolution），伍兹霍尔 马萨诸塞州，研究微生物生态学。

http://meren.org