fasta文件分析器。

nebfa的Python项目详细描述


用法:

>>> import nebfa
>>> rec = nebfa.parse(open("./test/data/basic.fa")).next()
>>> rec.id
('gi', '0120123123')
>>> rec.desc
'Some stuff'
>>> rec.sequence
'ACGT'
>>> rec.hash
'2108994E17F6CCA9FF2352ADA92B6511DB076034'

# Alternatively, parse_file avoids the need for a call to open. >>> for rec in nebfa.parse_file(“./test/data/multi.fa”): … print rec.id (‘gi’, ‘0120123123’) (‘ref’, ‘YP_234234.2’)

记录还有一个meta属性,它有两个用于标识符和 描述。当CTL-A分离时,您需要咨询该成员 放松。如果您有更好的语法建议,请发送一个注释。

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