MT动力学仿真
mtdynamics的Python项目详细描述
微管动力学模拟
有无物理障碍物时微管生长动力学的模拟。在
工作完成人：
- 模拟代码：Florian Huber和Maurits Kok
- 实验负责人：Maurits Kok和Svenja Marei Kalisch
- 玛丽莲·多特罗姆
模拟代码
在[即将发布]中提供了用于生成结果的完整模拟代码。
代码由主模拟代码（simulation）组成_主.py和模拟_函数.py）。模拟参数在Simulation中指定_参数.py。在plotting中提供了绘制结果的函数_函数.py。在
要求
Python 3.6或更高版本。在
安装
如果您使用Anaconda，则选择为mtdynamicsbu创建一个自己的环境，并运行以下命令：
# install mtdynamics in a new virtual environment to avoid dependency clashes
conda create --name mtdynamics python=3.7
conda activate mtdynamics
pip install mtdynamics
pip install jupyter # Optional, if you want to run jupyter notebooks from this environment
conda install -c anaconda pywin32 # Optional, if you run into win32api error (e.g. when using Python 3.8)
或者只需在现有环境中安装mtdynamics：
^{pr2}$运行模拟
提供Jupyter笔记本来说明如何运行模拟。它们可以在\notebooks文件夹中找到。在
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